סרט תעודי המבוסס על סרטי ארכיון ועדויות ניצולים. סיפוריהם של עקורי המלחמה היהודים ודרכם רצופת המכשולים לארץ ישראל. הם הגיעו בכל דרך אל חופי הים התיכון, אל ספינות ההעפלה, שנתפסה על ידי השלטון הבריטי כ"עליה בלתי ליגלתי". "הים האחרון" הוא השני בטרילוגית סרטי השואה שהופקו ע"י בית לוחמי הגטאות.