באמצע ספטמבר שלח הגסטפו הוראות למִפקדותיו המחוזיות (Gestapo-Leitstellen), ובהן הוא דרש להשלים את ההכנות הנחוצות לקראת השילוחים הקרבים. במכתב גם הוגדרו הקבוצות שפטורות מגירוש: יהודים שנשואים "נישואי תערובת" וילדיהם ה"יהודים למחצה", יהודים בעלי אזרחות זרה, עובדים בתעשיית המלחמה ויהודים בני 65 ומעלה.
עד דצמבר 1941 כבר יצאו שלושה שילוחים מהמבורג: שילוח אחד ללודז' ושניים למינסק. השילוח הרביעי היה אמור לצאת ב-4 בדצמבר, וגם הוא היה אמור להישלח למינסק, אבל בגלל "קשיים טכניים במסילת הברזל" שונה התכנון, היציאה נדחתה ל-6 בדצמבר והיעד שונה לריגה.
כשם שבגירושים הקודמים אתר הכינוס היה לשכת "הבונים החופשיים" לשעבר במורוויידנשטרסה (Moorweidenstrasse), כך היה גם בגירוש הזה. על פי ההנחיות שניתנו הותר לכל מגורש לקחת עִמו 50 ק"ג מטען ו-50 רייכסמארק. המגורשים נדרשו למלא הצהרה מפורטת על רכושם ולמסור את מפתחות דירתם לתחנת המשטרה הקרובה לפני שיתייצבו באתר הכינוס. עם הגעתם ללשכת "הבונים החופשיים" נדרשו היהודים להגיש את הצהרת הרכוש ואת כל הכסף שנותר ברשותם, לרבות 50 הרייכסמרק שהוזכרו לעיל. בודקים חיפשו במטענם חפצי ערך, תוקפן של תעודותיהם האישיות נשלל והמגורשים נכלאו בלילה במרתף המבנה בתנאי היגיינה גרועים. בזמן שהייתם במקום התעללו בהם השומרים....
Angelika Eder, "Die Deportationen im Spiegel lebensgeschichtlicher Interviews," in: Forschungsstelle für Zeitgeschichte in Hamburg und dem Institut für die Geschichte der deutschen Juden, Hrsg., Die Deportation der Hamburger Juden 1941-1945 (Hamburg: Forschungsstelle für Zeitgeschichte in Hamburg, 2002), pp. 45-59
Frank Bajohr, "Die Deportation der Juden: Initiativen und Reaktionen aus Hamburg." In: Beate Meyer (Hrsg.), Die Verfolgung und Ermordung der Hamburger Juden 1933-1945 (Hamburg: Landeszentrale für Politische Bildung Hamburg, 2006).
Linde Apel und Frank Bajohr, Die Deportation von Juden sowie Sinti und Roma vom Hannoverschen Bahnhof in Hamburg 1940–1945, in: Zeitgeschichte in Hamburg Nachrichten aus der Forschungsstelle für Zeitgeschichte in Hamburg (FZH) 2004, Hamburg 2005(, S. 21-63.
Ina Lorenz, "Aussichtsloses Bemühen. Die Arbeit der Jüdischen Gemeinde 1941–1945," in: Forschungsstelle für Zeitgeschichte in Hamburg und dem Institut für die Geschichte der deutschen Juden (Hrsg.), Die Deportation der Hamburger Juden 1941–1945 (Hamburg: Forschungsstelle für Zeitgeschichte in Hamburg, 2002), pp. 30–44.