שילוח S יצא מפילזן (Plzen) לגטו טרזיינשטט ב-22 בינואר 1942. זה היה השילוח השני מבין שלושה שילוחים גדולים שיצאו מפילזן. בשילוח היו 1,000 יהודים, מקצתם תושבי העיר פילזן ואחרים מעיירות ומכפרים שבסביבה, ובכללם: קרלוביצה (Kralovice, Kraltowitz), בלוביצה (Blovice, Blowitz), רדניצה (Radnice, Radnitz),רוקיצני (Rokycany, Rokitzan) והורוביצה (Horovice, Horowitz).
עובדים ממחלקת הטרנספורטים של הקהילה היהודית בפראג הגיעו למקום, ועל-פי הוראות המשרד המרכזי להגירת יהודים בפראג ביצעו לפני צאת השילוח עבודה ארגונית שכללה, בין השאר, הכנת רשימת המגורשים, רישום רכושם, הפצת הודעות על מועד השילוח ומתן סיוע ושירותי סבלות.
המגורשים שולחו מפילזן ברכבת. עם ההגעה לתחנה בבוהושוביצה (Bohusovice) הורדו המגורשים מהרכבת ואולצו לצעוד כשלושה קילומטר עד גטו טרזיינשטט.