ביולי 1940 גורשו יהודי פיזדרי בעגלות רתומות לסוסים וברגל לגטו זגורוב. תאריך הגירוש אינו ידוע במדויק, אך ידוע שהוא יצא בין 15 ל-18 ביולי 1940, וקרוב לוודאי ב-17 או ב-18 בחודש. באותם ימים גורשו יהודים נוספים מפיזדרי לגטאות ז'גוב וגרודזייץ.
רוב המגורשים מפיזדרי לא שרדו את השואה.